小昭寺位于拉薩古城之北，占地4000平方米。據說它是由文成公主主持、並由公主從內地帶來的建築師修建的，所以小昭寺的早期建築系仿漢唐風格。大門朝東，以寄托公主對家鄉父母的思念。

    寺廟取名“甲達熱木齊祖拉康”，意為“漢虎神變寺”。拉薩當地人管這兒叫做“熱木齊”，意思就是“漢人的”。

    小昭寺歷史上幾經火焚，現存的小昭寺的建築大多是後來重修的，只有底層神殿是早期的建築，殿內的10根柱子依稀可見吐蕃遺風：上面鏤刻著蓮花，並雕有花草、卷雲以及珠寶、六字真言。

    小昭寺主樓三層，底層分門庭、經堂、佛殿三部分，周圍是轉經廊道，廊壁上遍繪無量壽佛像。頂層是漢式金瓦，金光閃閃，凌空摩天，拉薩各個方位均能看到，蔚為壯觀。著名的拉薩上密院，也設在小昭寺內，這是格魯派僧人研讀佛經頗有成績的喇嘛進一步深造、修習密乘的地方，上密院堪布兼任小昭寺主持。